الانتقادات المنصبة على اتفاقية التجارة الحرة ياتي أغلبها من قطاع الزراعة العضوية الأوروبي، فالشكوك كبيرة حول نوعية الغذاء ومعايير الجودة، وحماية الحيوانات والمعايير البيئية - خاصة وان لا أحد يعلم التفاصيل التي يجري التفاوض حولها بهذا الخصوص، وما اذا كان ما سيُقر سيغيِر الأوضاع نحو الأفضل.